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科研小技能:若何操纵Norgen碳化硅手艺削减SARS-CoV-2的假阳性成果

宣布者:艾美捷科技宣布时辰:2021-03-12

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       您的COVID-19任务流程是否是能够不如您假想的那样精确?在COVID-19疫情起头时,研讨职员和尝试室抢先恐后地开辟了SARS-CoV-2测尝尝剂盒。经由进程大批的频频尝试,肯定了规范测试方式,并在天下范围内被普遍接管。可是,若是有一种比现行规范方式更精确的检测方式呢?

 

      天下须要大范围检测的处置计划,以有用解除假阳性,确保每一个人的宁静。若是持续往下看,您会领会到能够有更精确的COVID-19检测方式可用。


      COVID-19假阳性


      假阳性是研讨职员和临床大夫在操纵以后规范的SARS-CoV-2病毒RNA提取方式时面对的最大挑衅之一。


COVID-19假阳性


      经由进程鼻咽拭子或别的样本收罗方式收罗到样本后,将其存储在病毒运输介质(VTM)或通用运输介质(UTM)中。这便是挑衅的起头。培育基经常不能有用地保管病毒RNA,因为它只能在室温下不变临床样本中的病毒RNA长达3天。这致使病毒RNA的疾速降解/碎片化。另外,对宁静处置,VTM/UTM不能使样品无沾染性。


SARS-CoV-2病毒RNA提取


      病毒RNA碎片化为甚么那末首要?今朝的RNA提取规范(基于二氧化硅磁珠的手艺)不能有用地捕获高度片断化的RNA。这是因为基于二氧化硅的手艺偏向于连系更大的RNA序列。若是未完整捕获片断化的病毒RNA,则在基于qRT-PCR的检测中发生假阳性COVID-19成果的能够性将大大进步。


      COVID-19 RNA提取方式的比拟研讨


COVID-19 RNA提取方式的比拟研讨


      这与COVID-19规范化任务流程中的病毒RNA提取方式不分歧,是以Norgen团队停止了一项研讨,将Norgen的提取方式与基于二氧化硅磁珠的手艺停止了比拟。目标是肯定在捕获SARS-CoV-2片断化病毒RNA的敏理性方面,差别的RNA提取方式是否是存在差别。从Boca Biolistics(FL, USA)推销了44份临床鼻咽拭子样本。操纵FDA / EUA核准的PerkinElmer?SARS-CoV-2及时RT-PCR检测方式,对样本停止预挑选,确认44份样本为SARS-CoV-2阳性。


      二氧化硅OR碳化硅?


      研讨了两种RNA提取方式在检测上述44种临床样品中检测SARS-CoV-2病毒RNA的精确性方面的效力。

第一种方式是提取病毒RNA最经常操纵的方式,传统的基于二氧化硅磁珠的手艺(Zymo Research的Quick-DNA / RNA Viral MagBead)提取病毒RNA。第二种方式是基于碳化硅的提取方式(Norgen唾液/拭子RNA纯化试剂盒)。

RNA纯化手艺


      甚么是最好的RNA纯化手艺?


到这里任务逐步变得风趣起来。操纵这两种方式提取RNA,并操纵Norgen的2019-nCoV TaqMan RT-PCR Kit(Cat. TM67100)停止qRT-PCR检测,针对CDC保举的3个基因(N1、N2和RP)。

当比拟两种方式的qRT-PCR数据时,咱们发明基于二氧化硅磁珠的提取方式对SARS-CoV-2真阳性样本假阳性率为25%。在另外一方面中,和基于二氧化硅磁珠的方式比拟,基于碳化硅的提取方式发生了对SARS-CoV-2样本的100%的真阳性率和更分歧的Ct值。这些成果清晰地标明假阳性成果能够经由进程操纵基于Norgen碳化硅(SiC)的手艺而不是传统的基于二氧化硅的手艺来停止防止


qRT-PCR数据比拟


      若何改良您的COVID-19检测RNA提取流程


      碳化硅是一种新型的RNA提取手艺,具备超卓的RNA连系亲和力——出格是对小的、高度降解的RNA片断,如病毒RNA。碳化硅对一切RNA序列具备分歧的连系亲和力,对GC的含量或巨细不成见。另外,碳化硅不须要任何载体RNA或诸如苯酚/氯仿之类的无害化学物资。

      为甚么之前不传闻过基于碳化硅的RNA提取?


      碳化硅是Norgen Biotek的RNA提取专利手艺Norgen公司建立于1998年,总部位于加拿大安粗略省,一向操纵基于碳化硅手艺为客户从具备挑衅性的样本中大幅度进步RNA的产量和品质。今朝,Norgen的碳化硅(SiC)手艺已用于FDA核准的COVID-19任务流程中,以停止24小时大众测试。


      这对您来讲象征着甚么?


      检测尝试室必须操纵最精确的手艺,以确保靠得住报告SARS-CoV-2病毒传染环境。基于规范二氧化硅磁珠的提取方式能够不是检测SARS-CoV-2最精确的方式,正如在研讨中看到的,假阳性率为25%。

此刻是对全部筛查任务流程的品质停止评价的时辰了——从收罗生物样本,到病毒RNA提取,再到SARS-CoV-2检测——以终究掩护环球生齿的安康和宁静。


      在听完小编的先容后,您是否是很想晓得Norgen Biotek为泛博的科研任务者供给了哪些RNA提取相干产物呢?艾美捷科作为专业的性命迷信范畴处置计划供给商,为您保举中国区独家总代办署理Norgen Biotek品牌的局部RNA提取相干产物。


Norgen Biotek品牌的局部RNA提取相干产物

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      Norgen Biotek一向在不时的改良本身的产物。在不时完美产物的进程中,也会充实采取操纵者的定见。今朝Norgen Biotek正在停止一项“粪便搜集和保管等相干产物”的市场查询拜访,对在以下查询拜访表中提出的题目,很是接待中国的客户提出可贵的定见。


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